โรงเรียนบ้านในห้วย ตั้งอยู่ในท้องที่บ้านในห้วย เลขที่ 72/1 หมู่ที่ 7 ตำบลตากแดด อำเภอเมือง จังหวัดชุมพร โรงเรียนบ้านในห้วย สร้างเมื่อปี พ.ศ.2482 โดยนายหนู ยิกุสังข์ ครูใหญ่คนแรกและเป็นครูคนเดียวของโรงเรียนบ้านในห้วย ในสมัยที่โรงเรียนบ้านในห้วยยังไม่เปิดทำการเรียนการสอนอย่างเป็นทางการ ต่อมา นายหนู ยิกุสังข์ ได้บริจาคที่ดินเพื่อสร้างอาคารเรียนหลังแรกร่วมกับ นายอ่ำ อิทธิฤทธิ์ โดยอาศัยแรงงานราษฎรช่วยกันสร้างเป็นอาคารชั่วคราว เปิดสอนเมื่อวันที่ 1 มกราคม 2483 โดยมีนายหนู ยิกุสังข์ เป็นครูใหญ่คนแรก มีนักเรียนทั้งหมด 38 คน
พ.ศ. 2497 นายหนู ยิกุสังข์ ได้สละที่ดินของตนเองมอบให้ทางราชการ จำนวน 3 ไร่ 33 งาน 43 ตารางวา แล้วย้ายโรงเรียนมาสร้างใหม่ในที่ดินแปลงนี้เป็นการชั่วคราว
พ.ศ. 2500 นายหนู ยิกุสังข์ ร่วมกับผู้ปกครองบริจาคเงิน 20,000 บาท ทางราชการสมทบ 20,000 บาท รวมเป็นเงิน 40,000 บาท สร้างเป็นอาคารแบบเรือนประชาบาล ขนาด 2 อาคารเรียนเปิดใช้เมื่อ 1 มกราคม 2503
พ.ศ. 2504 ได้รับงบประมาณสนับสนุนอาคารเรียน 130,000 บาท (หนึ่งแสนสามหมื่นบาทถ้วน)
พ.ศ. 2515 นายสมปอง ยิกุสังข์ มาดำรงตำแหน่งครูใหญ่ตามคำสั่งองค์การบริหารส่วนจังหวัดชุมพร ที่ จพช. 02/10745 แล้วได้ขยายชั้นโรงเรียนถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ 7
พ.ศ. 2521 ได้รับงบประมาณก่อสร้างอาคารเรียนแบบ 017 ขนาด 4 ห้องเรียน 1 หลัง เป็นเงิน 400,000 บาท (สี่แสนบาทถ้วน) เริ่มใช้ตั้งแต่วันที่ 1 ตุลาคม 2512
พ.ศ. 2525 ได้ผ่านการประเมินรับรางวัลโรงเรียนดีเด่นรางวัลพระราชทานเข้ารับรางวัลพระราชทานจากพระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัวรัชกาลที่ 9
พ.ศ. 2527 ได้รับการจัดสรรงบประมาณต่อเติมอาคารเรียน 017 ชั้นล่าง 1 ห้องเรียน เป็นเงิน 60,000 บาท ผู้บริหารได้รับรางวัลผู้บริหารโรงเรียนดีเด่น และนักการภารโรงได้รับรางวัล นักการภารโรงตัวอย่างของประเทศ
พ.ศ. 2532 โรงเรียนชนะการประกวดกิจกรรมประชาธิปไตยดีเด่นของจังหวัดชุมพร
พ.ศ. 2534 นายสมปอง ยิกุสังข์ ได้ลาออกจากตำแหน่งผู้บริหารโรงเรียน และลาออกจากราช นายบรรจง โลกมิตร มาดำรงตำแหน่งแทน ตั้งแต่วันที่ 31 พฤษภาคม 2534 เป็นต้นไป
พ.ศ. 2537 เปิดสอนชั้นอนุบาลปีที่ 1
พ.ศ. 2538 จัดงานครบรอบ 55 ปี ได้เงินบริจาคจำนวน 130,000 บาท (หนึ่งแสนสามหมื่นบาทถ้วน) ในการปรับปรุงสภาพแวดล้อม
พ.ศ. 2539 ชนะการประกวดโรงเรียนสิ่งแวดล้อมดีเด่น
พ.ศ. 2540 เปิดสอนชั้นอนุบาล 3 ขวบขึ้น ปีแรกมีนักเรียน 19 คน และได้รับงบประมาณ 78,000 บาท (เจ็ดหมื่นแปดพันบาทถ้วน) ใช้ในโครงการปฏิรูปการศึกษาเป็นค่าวัสดุ ปรับปรุงโรงเรียน
พ.ศ. 2541 ได้รับงบประมาณปรับปรุงห้องวิทยาศาสตร์ จำนวน 39,000 บาท (สามหมื่นเก้าพันบาทถ้วน) และผู้ปกครอง คณะกรรมการสถานศึกษา ชุมชน คณะครู ร่วมกันบริจาคเงิน 120,000 บาท (หนึ่งแสนสองหมื่นบาทถ้วน) ต่อเติมอาคารเรียน 017 ชั้นล่าง ตามแบบราชการ จำนวน 2 ห้องเรียน และร่วมสร้างห้องน้ำ ห้องส้วม สำหรับนักเรียนชั้นอนุบาล 1 หลัง (2 ที่) เป็นเงิน 20,000 บาท (สองหมื่นบาทถ้วน)
พ.ศ. 2542 ได้รับการคัดเลือกให้เป็นศูนย์พัฒนากิจกรรมส่งเสริมการอ่านของสำนักงานประถมศึกษาจังหวัดชุมพร
พ.ศ. 2545 เข้าร่วมโครงการส่งเสริมสุขภาพของกรมอนามัย และผ่านเกณฑ์การประเมินในระดับจังหวัด และได้รับงบประมาณซ่อมแซมส้วม แบบ 401 4 ที่นั่ง เป็นเงิน 27,500 บาท (สองหมื่นเจ็ดพันห้าร้อยบาทถ้วน)
พ.ศ. 2548 คณะกรรมการสถานศึกษาขั้นพื้นฐาน จัดซื้อคอมพิวเตอร์จำนวน 10 ชุด
พ.ศ. 2549 ได้รับงบประมาณสนับสนุนจาก อบต. ตากแดด จัดทำห้องน้ำ ห้องส้วม ในห้องเรียนอนุบาล และเทพื้น ทำรั้วบริเวณหน้าอาคารเรียนอนุบาล ป.1 ก ซ่อมแซมของเล่นที่ชำรุดและปรับปรุงบริเวณตามหลักปรัชญาเศรษฐกิจพอเพียง
พ.ศ. 2551 - 2552 ได้รับรางวัลห้องสมุดดีเด่นโรงเรียนขนาดกลาง ได้รับคัดเลือกจาก สพท. ชุมพร เขต 1 ให้ดำเนินงานในโครงการส่งเสริมนิสัยรักการอ่าน (โครงการห้องสมุดมีชีวิต) ปูกระเบื้องเคลือบห้องเรียนชั้น ป.1 (อาคาร ป.1 ก) โดยการสนับสนุนงบประมาณจำนวน 15,000 บาท จากสหกรณ์ร้านค้าโรงเรียน
พ.ศ. 2559 อบต. ตากแดด ได้ย้ายนักเรียนชั้นอนุบาล 3 ขวบ ออกไปเรียนยังศูนย์พัฒนาเด็กเล็กทำให้ ในปีการศึกษา 2559 โรงเรียนบ้านในห้วย จัดการเรียนการสอน ตั้งแต่ชั้นอนุบาล 1 - 2 ชั้นประถมศึกษาปีที่ 1 - 6 เหลือเพียง 8 ห้องเรียน
พ.ศ. 2560 โรงเรียนบ้านในห้วย ได้รับการอนุมัติจาก สพฐ. ให้เปิดรับชั้นอนุบาล 3 ขวบ ซึ่งสามารถได้รับจำนวน 10 คน จนถึงปีการศึกษา 2562
พ.ศ. 2562 โรงเรียนบ้านในห้วย ยกเลิกการรับสมัครนักเรียนชั้นอนุบาล 3 ขวบ
ปัจจุบันโรงเรียนบ้านในห้วย เปิดสอนตั้งแต่ชั้นอนุบาล 2 ถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ 6 รวมทั้งหมด 8 ชั้นเรียน มีอาคารเรียน 3 หลัง 13 ห้องเรียน จัดทำเป็นห้องสำนักงานครู 1 ห้อง ห้องสมุด 1 ห้อง ห้องคอมพิวเตอร์ 1 ห้อง ห้องดนตรี 1 ห้อง ห้องพยาบาล 1 ห้อง ห้องสหกรณ์ 1 ห้อง ห้องเรียนชั้นอนุบาล และห้องเรียนชั้นประถมศึกษา รวม 7 ห้อง มีอาคารอเนกประสงค์ 1 หลัง บ้านพักครู 1 หลัง ส้วม 3 หลัง (10 ที่)